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其病因尚未完全闡明，目前有下列學說。
1.子宮內(nèi)膜種植學說經(jīng)血中的子宮內(nèi)膜細胞隨經(jīng)血經(jīng)輸卵管流入腹腔，種植在卵巢和鄰近的盆腔腹膜。
2.淋巴及靜脈播散學說子宮內(nèi)膜細胞可通過淋巴或靜脈轉移種植。
3.體腔上皮化生學說卵巢激素或經(jīng)血及慢性炎癥的反復刺激，可將體腔上皮激活轉化為子宮內(nèi)膜樣組織。
4.誘導學說未分化的腹膜組織在內(nèi)源性生物化學因素誘導下發(fā)展成子宮內(nèi)膜組織。
5.遺傳學說子宮內(nèi)膜異位癥可通過多基因或多因素遺傳。
6.免疫調(diào)節(jié)學說子宮內(nèi)膜異位癥病人的IgG及抗子宮內(nèi)膜抗體明顯增加，具有自身免疫性疾病的特征。
7.其他因素子宮內(nèi)膜異位癥病人腹腔液血管生成因子增多，導致異位內(nèi)膜種植和生長等。
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